Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srpk1O70551 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk1O70551 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk1O70551 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk1O70551 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk1O70551 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk1O70551 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk1O70551 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk1O70551 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk1O70551 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk1O70551 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk1O70551 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk1O70551 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk1O70551 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk1O70551 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk1O70551 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk1O70551 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk1O70551 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk1O70551 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk1O70551 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Srpk1O70551 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk1O70551 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk1O70551 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms