Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pitpnm1O35954 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pitpnm1O35954 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitpnm1O35954 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms