Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppef2O35385 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppef2O35385 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 381.8 ms