Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnih1O35372 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cnih1O35372 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnih1O35372 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnih1O35372 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnih1O35372 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cnih1O35372 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih1O35372 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih1O35372 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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