Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r34G3XA52 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r34G3XA52 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms