Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700067P10RikG3X8U2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700067P10RikG3X8U2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms