Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms