Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm4950D3YUM8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm4950D3YUM8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm4950D3YUM8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms