Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17333C6EQI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17333C6EQI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms