Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga9B8JK39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga9B8JK39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms