Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scml2B1AVB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms