Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt3B0QZW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt3B0QZW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms