Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef6A2A8M8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef6A2A8M8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms