Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28919A0A087WP35 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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