Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms