Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LgsnQ8CIX8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LgsnQ8CIX8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LgsnQ8CIX8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LgsnQ8CIX8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LgsnQ8CIX8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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