Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa26Q3L180 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa26Q3L180 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms