Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms