Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps8Q0P5W1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms