Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms