Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms