Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlgn1Q99K10 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms