Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf187Q8BFX1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf187Q8BFX1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf187Q8BFX1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf187Q8BFX1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf187Q8BFX1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf187Q8BFX1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf187Q8BFX1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms