Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Parp3Q3ULW8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms