Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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