Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms