Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL356259.1-201ENST00000443554 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ARHGEF38-IT1-201ENST00000512262 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FGF1-206ENST00000407758 759 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC027544.1-201ENST00000538408 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BX255925.2-201ENST00000605600 515 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL031651.2-201ENST00000620019 549 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms