Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms