Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms