Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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