Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms