Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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