Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms