Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
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