Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPB2P35606 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPB2P35606 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPB2P35606 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPB2P35606 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms