Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms