Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GabreA2AMW3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms