Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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