Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms