Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms