Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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