Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scg2Q03517 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms