Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms