Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms