Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smco4Q9JIS3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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