Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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