Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ctdnep1Q3TP92 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctdnep1Q3TP92 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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