Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms