Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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