Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms